La última participación de los rojillos fue en la temporada 2000/2001
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La de mañana no será la primera cita de la historia de la UD Lanzarote con la Copa Federación, competición que el club rojillo ha disputado en dos ocasiones, aunque la última se remonta a la temporada 2000/2001. En aquel entonces, las eliminatorias se disputaban a doble encuentro y la UD Lanzarote acumula 10 partidos disputados en la competición copera organizada por la Real Federación Española de Fútbol y que esta temporada tiene como premio la clasificación para la Copa del Rey en caso de alcanzar las semifinales.
La primera participación de la UD Lanzarote en la Copa Federación se remonta a la temporada 1999/2000, campaña en la que el equipo rojillo militaba por primera vez en la Segunda División “B” y estando Juan Manuel Rodríguez al frente del equipo. Al igual que en esta temporada, la UD Lanzarote afrontó la fase nacional de la competición, eliminando en las dos primeras rondas al Cádiz y Universidad de Las Palmas, cayendo eliminado en cuartos de final ante el Sabadell.
A la temporada siguiente, la UD Lanzarote regresaba a la Tercera División y también repetía participación en la Copa Federación. En la primera eliminatoria, los rojillos se enfrentaron al Castillo, empatando a dos goles en el partido de ida celebrado en la Ciudad Deportiva Lanzarote y venciendo por 1 a 2 en el choque de vuelta. En la segunda eliminatoria, la UD Lanzarote era eliminada por la UD Las Palmas Atlético, venciendo 1-0 en la ida y cayendo 2-0 en la vuelta celebrada en Barranco Seco.
En el partido de ida de esa eliminatoria, disputado el 22 de noviembre de 2000, el equipo dirigido por aquel entonces por Juan Antonio Machín saltó al terreno de juego con Víctor, Carlitos, Noé, Robayna, Santi Torres, Pedro Cruz, Vladimir, Morant, Jonatan Torres, Maciot y Santi Montesdeoca. Maciot fue sustituido en la primera parte por Rafa González y en la segunda parte entraban Güi por Santi Montesdeoca y Maikel Padrón por Morant. El gol de la victoria fue logrado por Morant, tras rematar una falta ejecutada por Carlitos.
En total, la UD Lanzarote ha disputado 10 encuentros en la Copa Federación, con un balance de 4 victorias, 4 empates y 3 derrotas. Decena de partidos en los que el conjunto rojillo materializó un total de 13 goles y encajó 10. Ante el CD Guadalajara será la tercera participación de la UD Lanzarote en la Copa Federación.